Chondrodysplasie
J'ai trouvé 3 gènes de dysplasie squelettique (2 hétérozygotes 'non définis' et un homozygote 'bon'). L'homozygote (appelé gène GNPAT) semble 'bon' uniquement parce qu'il est commun. Le premier est le gène ARSB et le deuxième est le gène PEX6. Les deux étaient sous 'Chondrodysplasie NOS' car ils étaient liés à plusieurs sous-types de chondrodysplasies, bien que le gène ARSB semble être plus communément associé aux mucopolysaccharidoses. Le gène PEX6 ne semble pas être un gène courant associé à la chondrodysplasie. Le gène GNPAT est commun à tous et est lié à la chondrodysplasie rhizomélique ponctuée de type 2, une condition qui affecte les bras supérieurs et les cuisses. Cependant, cela me préoccupe moins puisque c'est 'bon' et donc commun. Je suis plus inquiet de savoir si avoir deux gènes hétérozygotes avec un gène homozygote signifie automatiquement que l'on est porteur, affecté ou les deux ? J'ai lu que ceux ayant des gènes hétérozygotes de chondrodysplasie ponctuée sont porteurs. J'ai également lu que ceux qui sont affectés (pas porteurs) par l'achondroplasie ont un gène homozygote et un gène hétérozygote, tandis que les porteurs n'ont qu'un gène hétérozygote. L'achondroplasie et la chondrodysplasie ponctuée sont bien sûr deux sous-types différents de chondrodysplasie. L'achondroplasie est liée au gène du récepteur de croissance des fibroblastes 3 (FBRG3), que je n'ai pas selon Promethease. Cependant, 2 % des personnes affectées par l'achondroplasie n'ont pas ce gène. L'hypochondroplasie est liée au même gène, bien que 20 % des personnes affectées par l'hypochondroplasie ne l'aient pas. Quoi qu'il en soit, des personnes affectées par une dysplasie squelettique et des porteurs peuvent-ils avoir deux gènes hétérozygotes et un gène homozygote ? Un porteur ou une personne affectée peut-elle avoir plus d'un gène homozygote lié à une dysplasie squelettique ? Je me demande également si les techniques de test de Promethease sont similaires à d'autres tests génétiques cliniques (c'est-à-dire dans les hôpitaux). J'ai transféré mon échantillon depuis Ancestry DNA, qui ne teste pas médicalement. J'ai également été dirigé vers un conseiller en génétique, bien que je n'y sois pas encore allé. Je ne dis pas que j'ai une dysplasie squelettique. Je suis petit en raison d'un trouble endocrinien, bien que mon torse soit de taille moyenne. Ma arrière-grand-mère mesurait 1,27 m avec des jambes en biais. Sa fille mesure 1,45 m avec des problèmes de hanches. Ma mère mesure 1,50 m avec une scoliose. Les chances que nous ayons une chondrodysplasie sont probables. Cependant, ma mère et moi avons subi une amniocentèse avant ma naissance. Rien d'inhabituel n'a été observé, comme nous le savons. Je suis conscient que le conseil génétique peut 'manquer' des gènes et que ma mère ne se souvient pas de beaucoup de choses. Ma meilleure hypothèse concernant les gènes de chondrodysplasie étant 'non définis' est qu'ils ne sont ni communs ni un indicateur que vous êtes affecté. En fait, les tests génétiques cliniques ne sont pas toujours efficaces pour poser un diagnostic. J'ai le sentiment que certaines chondrodysplasies peuvent être des troubles endocriniens, car les gènes que j'ai notés (ARSB, PEX6 et GNPAT) sont liés à un manque de peroxysomes, qui sont des enzymes métaboliques.

Commentaires :

snpedia
2 upvotes | Posted on 2017-05-05 00:43:16
En l'absence de suppressions majeures, tout le monde a deux copies de chaque gène autosomal - une héritée de maman, une héritée de papa. Donc, il est tout à fait probable que vous ayez effectivement ces deux copies (dans les cellules de votre corps), que Promethease "dise" que vous les avez ou non. S'il n'y a aucun variant d'un gène répertorié dans votre rapport Promethease, c'est généralement parce qu'aucun des variants de ce gène listés dans SNPedia n'était dans les données (fichier) que vous avez téléchargées sur Promethease. Cela est généralement dû au fait que l'entreprise utilisée pour produire les données ADN 'brutes' n'a produit aucun résultat pour les SNPs dans SNPedia pour ce gène. Vous avez toujours ce gène (en vous), mais les positions exactes de ce gène correspondant aux variants nommés n'ont pas été testées. En ce qui concerne les variants dans un gène donné : en relation avec une condition ou une maladie donnée, un variant peut être tout, d'entièrement bénin à très probablement causant la maladie par lui-même ("pleinement pénétrant"). Puisque vous avez deux copies de la plupart des gènes, à chaque position dans un gène où il pourrait y avoir variation, vous avez deux séquences d'ADN possibles (nucléotides). Pour le moment, ignorons les insertions et suppressions et disons simplement que les choix de nucléotides uniques sont A, C, G ou T. Donc, les deux nucléotides que vous portez à une position donnée dans un gène donné constituent votre génotype pour ce variant. Les variants dans SNPedia sont nommés rs######, par exemple, rs1234567890, et donc un exemple de génotype est rs1234567890(A;G). Les génotypes, pas les gènes, sont ce que l'on appelle normalement homozygotes ou hétérozygotes. En termes d'hérédité, les conditions que vous mentionnez peuvent suivre des modes d'hérédité dominants ou récessifs. Un variant "mauvais" (pathogène), ce qui signifierait typiquement un génotype hétérozygote pour ce SNP, serait suffisant pour vous prédisposer à une condition héréditaire dominante. Donc, un "mauvais" génotype suffit à dominer (submerger) la copie normale restante du gène qu'une personne porte. Avec l'hérédité récessive, vous devez avoir les deux copies d'un gène non fonctionnelles. Cela peut se produire lorsqu'une personne est homozygote pour une mutation pathogène, signifiant qu'à un variant, les deux nucléotides ADN sont "le mauvais". Mais cela peut aussi se produire lorsqu'il y a un seul variant "mauvais" dans la copie du gène que vous avez hérité de maman, et qu'il y a un autre variant "mauvais", à un autre endroit dans ce gène, dans la copie que vous avez héritée de papa. Cela s'appelle l'hétérozygotie composite. Il y a beaucoup plus d'informations de base sur les sites que nous listons dans SNPedia comme bonnes ressources pour apprendre sur la génétique ici. La raison pour laquelle je m'étends là-dessus est d'espérer vous aider à comprendre toute littérature scientifique que vous lisez, et de vous aider à formuler les questions que vous pourriez avoir en des termes qui ont du sens compte tenu de la façon dont ces termes sont actuellement utilisés dans la littérature génétique et génomique (et dans les rapports Promethease ainsi que dans SNPedia). Être clair sur ce que signifient les termes et comment ils sont utilisés nous aidera, ainsi que les autres, à mieux comprendre vos questions, et au moins parfois, cela conduira à de meilleures réponses.
sanya4
1 upvotes | Posted on 2017-05-09 18:42:09
Tous les états inhérents ne sont pas pathogènes. L'ostéoporose, par exemple, est considérée comme une condition non pathogène car elle ne cause pas de maladie ; elle ne provoque que le affaiblissement des os. Du moins, c'est ce que j'ai lu. Cependant, le gène 'bon' (GNPAT) que j'ai mentionné est pathogène.
sanya4
1 upvotes | Posted on 2017-05-14 14:51:22
En réalité, il y a 3 gènes ARSB et plusieurs gènes de peroxysome (PEX6-PEX16, consécutivement).

Lien vers l'original

Nous accordons de l'importance à votre vie privée

Nous utilisons des cookies pour améliorer votre expérience de navigation, diffuser des publicités ou du contenu personnalisés, et analyser notre trafic. En cliquant sur "Tout accepter", vous consentez à l'utilisation de nos cookies.