Bonjour à tous, j'ai pensé que je ferais un post sur les tests NIPT, car ils sont si courants maintenant, ainsi que de donner aux gens une ressource pour obtenir des informations sur ce qu'est un test NIPT, ce qu'il teste et comment déterminer la possibilité d'un vrai positif à partir d'un appel à haut risque basé sur votre âge, ce qui s'appelle la valeur prédictive positive. J'ai également créé un sous-forum appelé r/NIPT avec beaucoup de ces informations, donc n'hésitez pas à le partager si vous souhaitez partager ces informations ou si vous connaissez quelqu'un qui les recherche. Il est destiné à soutenir ceux qui reçoivent des appels NIPT à haut risque et ceux qui ont reçu un résultat NIPT à faible risque mais se sont tout de même retrouvés avec un problème. Veuillez toujours parler à un conseiller en génétique de votre propre risque personnel concernant vos résultats NIPT. Qu'est-ce qu'un test NIPT (NIPS) ? Le test NIPT (NIPS) est un dépistage qui utilise ce qu'on appelle l'ADN libre circulant des cellules provenant de la couche externe des cellules placentaires (ce ne sont pas des cellules fœtales réelles, mais des débris placentaires provenant de la première couche de placenta) et les analyse en regardant leurs chromosomes pour les anomalies chromosomiques les plus courantes par deux méthodes différentes appelées WGS (séquençage du génome entier) ou SNP (qui mesure les polymorphismes de nucléotides uniques). Les tests NIPT dépistent le syndrome de Down (Trisomie 21), le syndrome d'Edward (Trisomie 18), le syndrome de Patau (Trisomie 13), le syndrome de Turner (chromosome X manquant) ou des chromosomes X ou Y supplémentaires (cela est très différent de l'amniocentèse qui analyse chaque chromosome et constitue un test de diagnostic, contrairement au NIPT qui est juste un test de dépistage). Lorsque votre bébé se développe à partir d'un embryon, il y a plusieurs étapes de développement. Au moment de la NT/NIPT/CVS/AMNIO, votre bébé a formé un tissu placentaire et un tissu fœtal à l'intérieur du placenta. En termes simples, le placenta a 2 couches, la couche externe s'appelle la couche cytotrophoblastique et la couche interne est appelée la couche mésenchymateuse. La couche cytotrophoblastique est la seule couche connectée à la circulation sanguine et est la seule couche qui libère de l'ADN libre dans le sang, donc les résultats du NIPT se basent uniquement sur les cellules trouvées dans la couche cytotrophoblastique. Il est important de noter qu'au cours du développement de l'embryon, la couche cytotrophoblastique est la couche trophoblastique de l'embryon, qui est la couche la plus externe de l'embryon pendant le développement. Cette couche subit fréquemment des mécanismes de correction embryonnaire avec des erreurs de mitose, ce qui peut entraîner des cellules anormales poussées vers cette couche, tandis que la masse cellulaire interne peut rester normale. Cela peut être assez courant chez les femmes plus jeunes. La masse cellulaire interne au stade de blasto cyste est composée du fœtus et de la couche mésenchymateuse qui devient plus tard le bébé et la couche placentaire interne. https:\/\/www.researchgate.net\/figure\/Early-embryonic-development-from-zygote-to-blastocyst-The-cytotrophoblast-which-is\_fig1\_290598144 C'est en fait le même concept que le test PGS en FIV. Comme vous le savez peut-être, les cellules prélevées pour la biopsie PGS proviennent de la couche trophoblastique qui devient plus tard la couche externe du placenta. Dans environ 2 % des grossesses, le placenta aura des couches de chromosomes anormaux alors que le bébé est normal (la plupart des gens auront une grossesse normale et ne feront jamais tester leur placenta à l'accouchement, mais cela a été prouvé dans des études). Chez les femmes plus jeunes, ces erreurs se produisent généralement pendant ce qu'on appelle la mitose - la division cellulaire après que l'ovule et le spermatozoïde se soient connectés et divisent rapidement, ce qui entraîne des erreurs. Celles-ci sont rapidement réparées par plusieurs mécanismes au stade embryonnaire appelés sauvetage de la trisomie, sauvetage de la monosomie, extrusion chromosomique vers le trophoblaste et une multitude d'autres mécanismes (allocation de l'aneuploidie dans le trophoblaste, avantage de croissance cellulaire des cellules diploïdes dans les embryons mosaïques, retard de la division des cellules aneuploïdes, extrusion ou duplication d'un chromosome aneuploïde, et l'abondance des produits des gènes de réparation de l'ADN. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23557100>). Chez les femmes plus âgées, les erreurs se produisent pendant ce qu'on appelle la MEIOSIS (les premières étapes de la division de l'ovule avant qu'il ne soit connecté au spermatozoïde) et sont moins susceptibles d'être réparées (bien qu'elles puissent toujours l'être par sauvetage de la trisomie et ce qu'on appelle la disomie uniparentale). Cela est important pour les résultats qui sont à haut risque dans la population plus âgée et entraîne donc une plus grande probabilité d'un vrai positif, car le mosaicisme est moins probable dans ce scénario. Plus la patiente est âgée, plus il est probable qu'un résultat anormal sur le NIPT (la couche externe du placenta) soit un vrai positif en raison de la capacité réduite des mécanismes de correction en place en raison de l'âge. C'est la raison principale pour laquelle plus la patiente est âgée, plus ces tests sont "précis". Cela n'a rien à voir avec le nombre de tests effectués, et faire plus de tests sur des patientes plus jeunes entraînera toujours davantage de cas de faux positifs. À mesure que le NIPT s'étend à la population plus jeune, nous verrons de plus en plus de cas de "faux positifs", car auparavant, il n'était proposé qu'à la population plus âgée à risque d'erreurs de méiose qui ne se corrigent pas d'elles-mêmes ou d'anomalies échographiques uniquement. De plus, le NIPT en lumière de preuves échographiques anormales, également appelées population "à haut risque", peut être un excellent outil pour recueillir plus d'informations sur les vrais cas positifs. * https:\/\/www.intechopen.com\/books\/placenta\/chorioangioma-of-placenta Pour cette raison, et du fait de la fréquence des erreurs de mitose chez les patientes plus jeunes, la couche externe du placenta qui subit tous les mécanismes de correction peut entraîner des résultats inexactes provenant du NIPT ainsi que du test CVS de la couche externe. Dans les cas de résultats échographiques anormaux et de CVS positif, le vrai positif est évidemment beaucoup plus définitif. La culture prolongée est celle qui fait croître les cellules mésenchymateuses qui sont plus étroitement liées aux cellules fœtales puisque les deux proviennent de la masse cellulaire interne dans la photo ci-dessus. En résumé : LES TESTS NIPT NE TESTENT PAS LES CELLules FŒTALES, mais dans la plupart des cas, les cellules fœtales correspondent également aux cellules de débris placentaires externes. C'est ce qui se passe dans toutes les grossesses "normales". L'ADN libre est constitué de cellules de la couche cytotrophoblastique qui faisaient partie de la couche trophoblastique dans le développement embryonnaire. Dans les résultats NIPT "anormaux", les erreurs se sont soit corrigées vers la couche placentaire et le fœtus peut être normal (ce qui est le scénario le plus probable dans la population plus jeune et entraîne un faux positif NIPT), SOIT le NIPT est un vrai positif dans ce cas les erreurs ne se sont pas corrigées et toutes les couches du placenta et du fœtus sont anormales. Le risque d'un vrai positif est basé sur l'âge de la femme au moment de la conception. Il existe également un scénario moins probable où la couche cytotrophoblastique est normale dans les tests PGS, NIPT et CVS et où les cellules fœtales sont anormales, car elles dérivent toutes de différentes couches de développement embryonnaire, mais cela est rare. SCAN NT (Translucidité nuchale) PEUT DÉTECTER DES ANOMALIES FŒTALES Y COMPRIS DES DÉFAUTS DU TUBE NEURAL/ANENCÉPHALIE/OMPHALOCÈLES, etc., que le NIPT ne peut pas. Vous pouvez donc toujours avoir une anomalie grave avec un TEST NIPT normal (cela m'est arrivé suite à un test NIPT normal et on a trouvé une anencéphalie lors de l'échographie NT, nous avons mis fin à cette grossesse pour des raisons médicales). Je ne sauterais personnellement pas l'échographie NT pour cette raison. Pendant ce temps, vous aurez également les hormones HCG et PAPP-A prélevées et leurs ratios peuvent également donner un aperçu du fonctionnement du placenta et d'un risque accru de complications potentielles dues à une dysfonction placentaire que le NIPT ne peut pas détecter. Cependant, l'échographie NT et le dépistage combiné triple sont toujours moins sensibles que le NIPT pour les troubles chromosomiques énumérés ci-dessus. Cependant, cela sert, selon moi, un but différent et complémentaire au test NIPT et avoir les deux est tout à fait approprié pour cette raison. * ______________________________________________________________ Tout d'abord, définissons quelques-uns de ces autres termes confus liés au NIPT : Les tests NIPT sont annoncés comme étant précis à 99 % avec 99 % de sensibilité et 99 % de spécificité. * Sensibilité - la proportion de personnes qui testent positif parmi tous ceux qui ont réellement la maladie. * Spécificité - c'est la proportion de personnes qui testent négatif parmi toutes celles qui n'ont réellement pas cette maladie. * Valeur prédictive positive - la probabilité qu'après un résultat de test positif, cette personne ait réellement cette maladie spécifique. * Valeur prédictive négative - la probabilité qu'après un résultat de test négatif, cette personne n'aie réellement pas cette maladie spécifique. > Pour tout test donné (c'est-à-dire que la sensibilité et la spécificité restent les mêmes), à mesure que la prévalence diminue, la VPP diminue car il y aura plus de faux positifs pour chaque vrai positif. C'est parce que vous cherchez une "aiguille dans une botte de foin" et êtes susceptible de trouver beaucoup d'autres choses qui ressemblent à une aiguille en chemin - plus la botte de foin est grande, plus vous êtes susceptible de confondre des choses avec une aiguille. (c'est-à-dire que les micro-délétions et d'autres anomalies chromosomiques qui sont extrêmement rares) (https://geekymedics.com/sensitivity-specificity-ppv-and-npv/> ) UN RESULTAT POSITIF DU NIPT NE SIGNIFIE PAS QU'IL Y A 99 % DE CHANCES QUE VOTRE ENFANT AIE LE TROUBLE. Cela est déterminé par quelque chose qui s'appelle la valeur prédictive positive (voir ci-dessus) : la chance qu'un dépistage positif soit réellement positif. Ces calculateurs peuvent être utilisés pour calculer cette possibilité spécifique à votre âge, car elle est basée sur la prévalence (à quelle fréquence vous trouvez la maladie dans la population générale à votre âge spécifique). Donc, pour quelqu'un qui a 20 ans, la valeur prédictive positive sera beaucoup plus basse que pour quelqu'un qui a 43 ans, car les chances d'anomalies chromosomiques augmentent avec l'âge. https://www.perinatalquality.org/Vendors/NSGC/NIPT/> https://www.med.unc.edu/mfm/nips-calc/> Cependant, le plus gros problème est le manque de conseils avant de passer le test concernant le VPP. Quiconque reçoit un résultat positif a évidemment très concrètement et très effrayant des chances d'avoir un vrai positif qui doit être confirmé par des tests diagnostiques. Juste la façon dont c'est annoncé comme étant précis à 99 % dans la plupart des pratiques est extrêmement inexacte pour ceux qui reçoivent des résultats positifs. Les conseillers en génétique sont notoirement frustrés par ces statistiques annoncées lorsqu'ils conseillent des patientes qui reçoivent des appels à haut risque. AUCUN de ces tests n'annonce leur valeur prédictive positive et très peu d'entre eux les rapportent réellement dans les résultats. La véritable statistique pour une femme de 25 ans en appel positif ou à haut risque pour un résultat NIPT est de 50 % de VPP pour T21, seulement 15 % de vrai positif pour T18, seulement 7 % de vrai positif pour T13, ce qui provoque beaucoup de détresse pour certains des chromosomes plus rares. Leurs données publicitaires incluent toujours un astérisque * indiquant que des études ont été réalisées chez des patientes à risque élevé. Pour une femme de 40 ans, ces statistiques sont beaucoup plus élevées avec une VPP de 93 % pour T21, 70 % pour T18 et 50 % pour T13, ce qui est dû à une augmentation de la probabilité d'erreurs de méiose qui ne sont pas réparées/ne se corrigent pas, contrairement aux erreurs de mitose chez les femmes plus jeunes, mais même chez les patientes plus âgées, les appels à haut risque T18 et T13 peuvent être inexactes. Il est très évident que cela n'exclut pas les jeunes femmes des résultats positifs réels, et c'est extrêmement malheureux lorsque vous faites partie de cette très faible statistique, j'y ai été moi-même. Chaque test que vous passez indique ses statistiques de sensibilité et de spécificité, qui peuvent être utilisées pour calculer la VPP et la VPN ; cependant, prenez cela avec un grain de sel. Moins il y a de personnes testées, plus ces indicateurs peuvent être inexactes car les anomalies chromosomiques restent rares dans une population génétique. Par conséquent, ces tests sont les plus précis pour la trisomie 21, et moins précis pour les trisomies 13, 18 et les diagnostics monosomiques X. Les micro-délétions et tout autre NIPT élargi pour d'autres chromosomes auront des valeurs prédictives positives très basses en raison de la très faible prévalence de ces maladies. TYPES DE TESTS NIPT Les tests NIPT utilisent 2 technologies différentes appelées WGS (technologie de séquençage de génome entier) et SNP (test prénatal non invasif basé sur le polymorphisme de nucléotides uniques (SNP)). Ils utilisent tous deux ce qu'on appelle l'ADN libre circulant, qui est des débris de la couche externe du placenta appelée cytotrophoblaste flottant dans le sang de la mère. Le pourcentage de ces débris s'appelle le % de fraction fœtale (ce qui est vraiment un abus de langage car CE NE SONT PAS DES CELLULES FŒTALES ET CE N'EST PAS DE L'ADN FŒTAL - ce sont des cellules placentaires) Les tests basés sur SNP : Panorama (Natera), Harmony (Ariosa) nécessitent une fraction fœtale de 4 % pour un résultat précis et envoient donc un rapport non concluant en raison d'une faible fraction fœtale. Leurs rapports peuvent indiquer "faible fraction fœtale" et ils peuvent nécessiter une nouvelle prise de sang. Les tests WGS : Verifi Prenatal Test (Illumina), PrenaTest (LifeCodexx/GATC Biotech AG), NIFTY Test (BGI), MaterniT21 PLUS Test (Sequenom), Bambni Assay (Berry Genomics) ne nécessitent pas de fraction fœtale de 4 % et peuvent toujours émettre un appel à haut risque à des fractions fœtales plus faibles. AMNIO VS CVS Considérez la possibilité de faire une amniocentèse si vous avez une grossesse sonographiquement normale en raison de la possibilité de mosaicisme placentaire confiné, ce qui montrerait une CVS positive mais une amnio négative. En cas de grossesse sonographiquement anormale, la CVS devrait être satisfaisante. Ceci est particulièrement important pour le diagnostic de monosomie X, trisomie 13 et trisomie 18, car le mosaicisme placentaire est très courant pour ces chromosomes. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1715446/>), ce qui signifie qu'en l'absence de preuves échographiques de ces trisomies, la CVS POURRAIT être erronée en combinaison avec le test NIPT. > "Nous conseillons la prudence lorsque la CVS est utilisée après un NIPT. L'exactitude diagnostique de la CVS a été établie principalement sur la base d'études de femmes d'âge maternel avancé qui étaient à risque d'aneuploïdie non mosaïque résultant d'une non-disjonction méiotique.4 Le NIPT identifie les femmes avec des cellules aneuploïdes dans le placenta qui ont résulté d'erreurs méiotique et mitotique. Les erreurs mitotiques entraînent souvent le mosaicisme. Par conséquent, le mosaicisme placentaire peut être beaucoup plus commun chez les femmes ayant des résultats NIPT positifs. La présence de mosaicisme placentaire confiné a compté pour au moins 3.6 % des appels à haut risque dans l'étude de Dar et al.2 Dans 2 cas où la CVS semblait confirmer un appel à haut risque, une évaluation de suivi a révélé que le fœtus était en fait normal. D'autres ont rapporté des résultats similaires. Par conséquent, nous croyons qu'à ce jour, un résultat anormal de la CVS ne devrait pas être considéré comme pleinement diagnostique. Les cas NIPT-positifs, CVS-positifs nécessitent une confirmation par amniocentèse ou échographies pour prévenir la interruption d'une grossesse normale." (https://www.ajog.org/article/S0002-9378(15)00589-X/fulltext00589-X/fulltext) > > Nous tenons à remercier Dar et al pour leurs commentaires, notamment concernant la nécessité de la prudence lors de l'utilisation de l'échantillonnage de villosités choriales (CVS) comme suivi d'un dépistage prénatal non invasif (NIPS) anormal. Nous convenons que l'amniocentèse est en effet la meilleure option plutôt que la CVS pour l'évaluation de suivi du NIPS. Étant donné que la composante "fœtale" de l'ADN libre circulant utilisé dans le NIPS est en réalité d'origine trophoblastique, tout aneuploïdie suspectée par cette méthode de dépistage est mieux confirmée par des études cytogénétiques sur les cellules du liquide amniotique, car les villosités choriales pourraient simplement refléter les "faux positifs" du NIPS. Le mosaicisme placentaire confiné des types qui peuvent donner un résultat cytogénétique positif de CVS survient dans environ 0.8 % des grossesses (309/52,673 grossesses) ; une fraction de celles-ci aurait un pourcentage suffisamment élevé de mosaicisme pour donner un résultat positif NIPS.1 En dépit des lacunes de la CVS en tant que méthode de détermination de l'exactitude du NIPS, une partie de l'intention de notre article était de mettre l'accent sur la performance du NIPS du point de vue d'un laboratoire de cytogénétique. D'après notre expérience, 32 % de nos échantillons diagnostiques de suivi NIPS provenaient de la CVS. Cela suggère que de nombreuses patientes ayant un premier NIPS précoce peuvent ne pas vouloir attendre jusqu'à 15 semaines de gestation pour clarifier un résultat positif NIPS par amniocentèse. - Jeanne M. Meck, PhD GeneDx Gaithersburg, MD jmeck@genedx.com](mailto:jmeck@genedx.com) Athena M. Cherry, PhD Stanford University [https://www.ajog.org/article/S0002-9378(15)00589-X/pdf00589-X/pdf) \\\ CAUSES DES FAUX POSITIFS DES TESTS NIPT \\\ * Mosaicisme placentaire confiné (CPM) - Ceci est causé par une population de cellules dans le placenta avec trois copies au lieu des deux habituelles. Ces cellules sont confinées au placenta et ne sont pas présentes chez le bébé. * Résultat faussement positif statistique - Il s'agit d'un résultat incorrect sans cause biologique apparente. * Démise d'un jumeau - Lorsque l'un des jumeaux a été perdu plus tôt dans la grossesse et était génétiquement anormal. * Trisomies autosomiques rares dans le placenta entraînant un faux positif des 4 chromosomes "régulièrement testés". * Anomalies chromosomiques maternelles - propre mosaicisme. * Cancers maternels. Mosaicisme placentaire confiné et croissance fœtale intra-utérine - https://fn.bmj.com/content/79/3/F223> Il existe 3 types de mosaicisme placentaire. Les types 1 et 2 ne causent généralement aucun problème pour le développement du bébé. Le type 3 peut causer des problèmes tels que IUGR, prééclampsie, faible poids à la naissance. Voici un tableau de la prévalence du CPM et des types de mosaicisme trouvés dans certaines trisomies chromosomiques. La trisomie 16 dans le placenta est la cause la plus courante de l'IUGR pendant la grossesse. Comme nous pouvons le voir, c'est presque toujours un type CMP III. https:\/\/fn.bmj.com\/content\/79\/3\/F223 > Le mosaicisme placentaire confiné (CPM) est défini comme la présence d'anomalies chromosomiques dans le tissu extra-embryonnaire qui sont absentes du tissu fœtal \[1\]. Ces anomalies chromosomiques sont observées dans environ 1 à 2 % des échantillons de villosités choriales (CVS) réalisés pour un diagnostic prénatal entre la 9e et la 12e semaine d'aménorrhée (semaines) \[2\]. Une fois identifiées, les CPM peuvent être classées en trois sous-types (types 1, 2 et 3 CPM) selon la localisation placentaire de l'anomalie chromosomique \[1\]. > > Dans le type 1 CPM (CPM1), l'anomalie chromosomique est trouvée exclusivement dans le cytotrophoblaste (c'est-à-dire que l'anomalie chromosomique n'est observée qu'après examen des villosités en culture à court terme (STC-villosités)). > > Pour le type 2 CPM (CPM2), l'anomalie chromosomique est limitée au noyau mésenchymateux des villosités choriales (c'est-à-dire que l'anomalie chromosomique n'est observée qu'après examen des villosités en culture à long terme (LTC-villosités)). > > Le type 3 CPM (CPM3) est défini comme la présence d'une anomalie chromosomique à la fois dans le cytotrophoblaste et dans le noyau mésenchymateux des villosités choriales (c'est-à-dire que l'anomalie chromosomique est présente après analyse des villosités STC et LTC). (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5897023/>) > > Notre rapport a démontré que les CPM3 étaient clairement associés aux naissances prématurées, aux faibles poids à la naissance et à des issues de grossesse défavorables, tandis que les CPM2 n'avaient aucun effet sur le développement fœtal. Cependant, l'influence des sous-types de CPM sur la croissance fœtale est restée un sujet controversé \[23, 24\]. Dans la présente étude, nous confirmons que les CPM2 n'ont pas influencé le développement fœtal. En revanche, les grossesses avec CPM3 étaient associées à des naissances prématurées, des nouveau-nés SGA et des issues de grossesse défavorables. Nous sommes donc en accord avec les auteurs pour qui les CPM d'origine méiotique (principalement CPM3) sont associés à un risque accru de restriction de croissance intra-utérine et de nouveau-nés SGA \[9, 25\]. Et enfin, voici le tableau qui peut mener à des résultats faux positifs et faux négatifs sur le NIPT en fonction des types de mosaicisme placentaire. https:\/\/simul-europe.com\/2017\/dip\/Files\/\(ilirtasha@yahoo.com\)abstrakti%20barcelone.pdf La plupart des femmes passent le test NIPT sans trop y penser, et pour la plupart des gens, les résultats seront normaux, associés à une grossesse normale. Cela ne veut pas dire que les gens ne devraient pas passer un test NIPT, mais afin que les gens comprennent les limitations de celui-ci et qu'il s'agit vraiment d'un test de dépistage - et non d'un test de diagnostic pour les raisons évoquées ci-dessus. C'est TOUJOURS le meilleur test non invasif que les gens peuvent avoir pour le diagnostic des anomalies chromosomiques mentionnées ci-dessus - ce n'est juste pas toujours exact, donc c'est un test de dépistage. Cependant, lorsque le résultat revient anormal, cela peut être extrêmement pénible, très triste, très déroutant. Vous voulez de l'espoir, mais vous ne voulez pas de faux espoirs. Ensuite, vous voulez des statistiques et des probabilités, et vous voulez simplement que votre médecin vous dise ce qui se passe. Ensuite, vous voulez une réponse définitive. Vous voulez des histoires et peut-être que vous avez besoin de soutien. J'espère que vous trouvez les informations ci-dessus utiles quant à la façon dont certains de ces résultats peuvent vous affecter ou d'où ils proviennent. Pour ceux qui finissent par avoir des tests diagnostiques confirmant les résultats, je suis très désolé pour vos épreuves et pour toute perte que vous pourriez éprouver. J'y ai été et la communauté r/ttcafterloss m'a beaucoup aidé pendant ces moments. Edit : depuis que j'ai écrit ce post, lorsqu'on a eu un + pour le résultat nIPT de trisomie 18, l'amnio a montré une fille chromosomiquement normale, donc le NIPT était un faux positif.